分子動力學模擬
▲ 分子動力學模擬
分子動力學模擬技術原理簡介 分子動力學(Molecular Dynamics,MD)模擬是一套分子模擬方法,該方法主要是依靠牛頓力學來模擬分子體系的運動,在由分子體系的不同狀態構成的系統中抽取樣本,計算體系的熱力學量和其他宏觀性質。引入量子力學方法后,可將研究領域進一步擴展到反應機理的研究。
適用范圍 分析配體-受體復合物體系的相互作用機制:相互作用模式、誘導契合效應、蛋白骨架運動;
預測活性小分子的結合自由能,闡明機理或指導結構改造;
優化蛋白結構,如對同源模建得到的結構進行結構優化。


